Goku, Pan e Trunks conhecem Baby, que pertence à espécie mais inteligente do Universo, que foi quase toda eliminada pelos Sayajins, os Tsufurujins.[5] Baby foi robotizado pelo Doutor Myuu. Ele chega à Terra, implanta ovos em quase todos os terrestres e toma controle do corpo de Vegeta. Quando Goku volta à Terra, quase todos os terráqueos estavam sendo controlados por Baby, até mesmo Dendê. Então, Goku teve de lutar contra os seus próprios filhos, Gohan e Goten, e depois aparece Baby Vegeta. Goku se transforma em Super Saiyajin 3 e os dois guerreiros lutam, mas, como Baby Vegeta era mais forte, Goku perde. Quando Baby lança seu poder mortal — A Super Bola Mortal de Rancor —, Goku é salvo por Kibitoshin. No entanto, devido à influência das energias da Grande Bola de Rancor, Goku é teleportado para o universo dos enigmas. Porém, Goku havia deixado as Esferas do Dragão Negras com Dendê, que entregou a Baby e este pediu que fizesse um novo planeta, igual ao seu antigo planeta natal antes de ser destruído pelos Saiyajins. Quando conseguiu sair de lá, resolveu fazer o mesmo treinamento que o Supremo Kaioshin fez com Gohan; assim, Ro Kaioshin faz com que Goku voltasse a ter rabo. Enquanto isso, seu discípulo, Oob, lutava contra Baby; ele não teve chances mesmo após se fundir com Boo, fazendo com que o mesmo ampliasse seus poderes. Assim, Goku teve de voltar ao mundo para lutar novamente contra Baby Vegeta. Ele chega quando Baby derrota Oob, que tentara transformá-lo em doce. Novamente transformado em Super Saiyajin 3, Goku perde mais uma vez. Quando Baby se mostrava vitorioso, Goku olha para a terra e recebe 100.000 raios blutz, transformando-se, assim, em um Golden Oozaru, que é mais forte que um Super Saiyajin 3, apesar de o mesmo ter ficado incontrolável. Pan, que por sua vez não estava possuída pelos ovos de Baby, fez com que seu avô recuperasse a consciência e, assim, Goku sofre uma nova e poderosa transformação, o Super Saiyajin 4, que é um misto de Super Saiyajin com Oozaru. Ao testar seus novos poderes, Goku mostra que é muito mais poderoso do que Baby. No entanto, Bulma, que estava possuída por um dos ovos de Baby, construiu uma máquina de raios blutz e disparou contra Baby Vegeta, que se transformou em um Golden Oozaru, resultando em uma luta de igual para igual. Quando Baby estava em vantagem, Goku dispara um Kamehameha aumentado em 10 vezes. Baby sai do corpo de Vegeta e tenta fugir com sua nave, mas Goku lança outro Kamehameha, desta vez na nave de Baby, quando esta passava pelo Sol. Assim, Goku finalmente consegue matar o Tsufurujin. Após a morte de Baby, a turma descobre que a Terra iria explodir em duas semanas, e eles têm a ideia de transportar os humanos ao planeta Tsufuru. Todo mundo sai da Terra, exceto Piccolo, que dissera a Gohan que, se ele morresse, as esferas do dragão de estrelas negras virariam pedras, posto que ele havia se fundido com o Kami Sama anterior, que criara tais esferas. Tudo Volta Ao Normal , Até Que no inferno Dr Myuu e Dr Gero constroem outro androide número 17 para sincronizar com o 17 da terra para unir os dois e a terra entrar em um colapso. Depois disso Trunks chega na casa de Goku ferido. Ele conta que foi o androide 17 que o atacou e disse para Goku ir ao inferno. Goku não quis ir, mas Bulma disse sobre o que acontecer se Freeza e Cell forem ressuscitados. Goku foi até o inferno mas ele ficou preso lá, depois ele luta com Freeza e Cell, enquanto isso na terra a 18 é hipnotizada por 17 ( Quando Ele Convida Os Olhos Dos Dois Ficam Vermelhos ) . Kuririn Tira A 18 Do Transe Hipnótico feito pelo 17, pergunta a ele e morre com um ataque do 17. Ela Tenta Se Vingar muito triste e não consegue. Os Dois 17 se fundem. Os guerreiros Z lutaram contra os que tinham ressuscitado do inferno e os derrotam. Depois de Goku derrotar Freeza e Cell, Piccolo chega lá, e uniu seus pensamentos com Dende para unir os dois mundos de novo. Outra parte do plano do Dr Myuu e Dr Gero era fazer os dois androides 17 se fundirem, e formarem o Super 17.[5] Vegeta não causa nenhum dano nele mesmo dando um golpe bem forte, e nem Majuub, então Vegeta se transforma em super sayajin 2 para lutar. Goten, Trunks e Gohan se transformam em super sayajin, mas foram derrotados facilmente, e Vegeta deu o Golpe do Resplendor Final no Super 17 e não causou nenhum dano nele, depois o super 17 ia lançar uma rajada gigante em vegeta, mas ele foi salvo por Goku, e a luta de Goku e o Super 17 começou, Goku se transforma em Super sayajin, mas nada consegue fazer, por isso ele se transforma em Super sayajin 4. Goku atira rajadas no Super 17, o que não sabia é que ele pode absorver poder, e a situação piora quando ele absorveu o kamehameha aumentado 10x. A número 18 aparece por quê 17 da terra matou Kuririn, e ela quer se vingar da morte dele e quando o Super 17 fere a 18 ela Provoca Super 17. Mesmo ferida com a roupa quase rasgada . Ela ficou atirando Rajadas de Ki no super 17, isso foi uma distração, e Goku aproveita e fura a barriga do Super 17 com o Golpe do Dragão e o mata com um kamehameha. Goku foi pedir ao Shen-Long que ressuscitasse todas as pessoas que tinham sido mortas, mas as Esferas do Dragão estão a mudar. Aparecem vários Shen-Longs Malignos, e Goku os derrota um a um, exceto pelo dragão de Quatro estrelas, que se mostra com uma personalidade boa. De repente, aparece Li Shen-Long, o Dragão de uma estrela, Goku luta contra o Dragão, que se mostra mais forte que ele, e então Goku come a esfera de quatro estrelas, e cria uma convicção com o dragão de quatro estrelas, pois a esfera vai parar em sua testa. De repente, Li Shen Long absorve as demais esferas do dragão e assim atinge a sua transformação mais poderosa, se tornando Omega Shenron, que era muito mais forte que Goku Super Saiyajin 4, quando tudo parecia estar perdido, Vegeta aparece, que, com a ajuda de sua esposa Bulma e sua máquina de raios blutz, se transforma em Super Saiyajin 4 (O uso da máquina para a transformação se dá ao fato de que Vegeta haverá perdido sua cauda). Vegeta alerta Goku que eles, mesmo transformados em Super Saiyajin 4, não conseguiriam vencer Omega Shenron, quando de repente, Vegeta avisa ao mesmo que eles precisam fazer a fusão para vencer o Dragão. Enquanto Gohan, Trunks e Goten distraem Omega Shenron, Goku e Vegeta aproveitam para realizarem a Fusão, e assim com a fusão de dois Super Saiyajins 4, nasce o Guerreiro mais poderoso de toda a saga Dragon Ball, Gogeta Super Saiyajin 4, com um poder muitíssimo maior do que Omega Shenron. Porém, a fusão dura menos de 10 minutos e a personalidade brincalhona do novo guerreiro impede a destruição do dragão. Omega Shenron não permite que Goku e Vegeta façam a fusão novamente. Goku e Vegeta ao gastarem todas as suas energias contra o Dragão de uma estrela, voltam ao seus estados normais. Quando tudo estava perdido, Goku ressurge e cria a Genki-Dama Universal, formada com a energia de todos os seres do universo e destrói Omega Shenron de uma vez por todas. Mas quando o Shen-Long original aparece, sem sequer ser chamado, ele ressuscita Goku como uma entidade que receberá o dever de zelar pelo equilíbrio universal, ele diz que não vai realizar mais nenhum desejo, porém Goku convence a realizar um último desejo, que era ressuscitar todas as pessoas da Terra que foram mortas por Li Shen-Long. 100 anos depois, Pan já está bem velha, e seu neto, Goku Jr., que é idêntico a Goku, participa do Torneio de Artes Marciais onde luta na final contra Vegeta Jr., que é idêntico a Vegeta. Os dois lutam enquanto Goku aparece para assistir a luta dos jovens Saiyajins e depois vai embora.
